NVIDIA i Uniwersytet Waszyngtoński prezentują RFD4-Proteina do szybszego projektowania białek z AI
Zespół NVIDIA BioNeMo wspólnie z Institute for Protein Design na Uniwersytecie Waszyngtońskim zaprezentował RFD4-Proteina – model, który w jednym kroku generuje zarówno sekwencję białka, jak i pełną strukturę atomową, eliminując oddzielny etap inverse-folding stosowany we wcześniejszych rozwiązaniach. Dzięki pracy na reprezentacji na poziomie reszt (residue-level) oraz uproszczonemu procesowi dyfuzji, model wymaga tylko około 60 kroków odszumiania zamiast wcześniejszych ok. 400, co przekłada się na wyraźnie szybsze generowanie i znacznie mniejsze zużycie pamięci niż poprzednik RFD3 przy generowaniu białka o 200 resztach. Podczas generowania model może także prowadzić wyszukiwanie sterowane nagrodą (reward-guided search), które ocenia i rozwija częściowe projekty za pomocą narzędzi przyspieszanych przez GPU, takich jak OpenFold3 i TMol. Model jest dostępny zarówno jako otwarty model na GitHub, jak i jako mikroserwis NIM z interfejsem HTTP, a dedykowane narzędzia pozwalają zautomatyzowanym agentom łączyć etapy generowania, wyszukiwania i oceny.